Problème classique!
La solution c'est de compiler 2 PHP différents en CGI, et d'indiquer dans le httpd.conf lequel on utilise en fonction de la directive AddHandler utilisée
Voici l'ensemble de la procédure (version brute)
http://therebel.free.fr/2phpcgi.htm
Dans ce document, mon but était de fournir 2 php 4 compilés avec des directives différentes. C'est exactement pareil pour un PHP4 et un PHP5.
J'ai compilé avec le support suexec qui est plus sur pour le PHP compilé en CGI (car les scripts sont executés par le user du virtualhost)
A+
TheRebel